Павел Мики родился в 1656 году в Киото. Был крещен вместе со своими родителями в возрасте пяти лет, и отец послал его учиться к иезуитам. Образ жизни Мики отличался постоянным совершенствованием в подражании Христу и служении Евангелию. После плодотворного периода деятельности в Кюсю он был направлен в центральную Японию, где добился больших успехов, особенно среди самураев. Именно здесь его арестовали в декабре 1596 года. В начале февраля 1597 года Павел Мики вместе с другими японскими католиками и несколькими европейскими католическими миссионерами был подвергнут пытке: им отрубили часть левого уха и провели истекающих кровью по улицам города Мияко. Затем их перевезли в Нагасаки, чтобы там казнить через распятие. Поначалу каждого из мучеников приковали к лежащему на земле кресту, который затем воткнули в землю в ряд на расстоянии нескольких метров друг от друга и потом убили каждого одновременным ударом копья.
В 1862 г. Павел Мики вместе с другими двадцатью пятью японскими мучениками был канонизирован Папой Пием IX.
День памяти – 6 февраля.